一个自制的生物信息学程序。
这个程序目的是在基因组文件bsubt168_whole.nuc(部分)中查找设置文件ss.ini所记录的短核苷酸序列CTTAAG(这种短核苷酸一般称寡核苷酸)及其互补序列在该基因组的每10000个碱基中出现的次数。
程序先将碰到的寡核苷酸及其互补序列的位置保存在临时文件ss.tmp中,然后利用这个文件统计每10000个碱基中它们的出现次数并记录在ss.csv中(可用excel打开)。如果某10000个碱基中的出现次数为0,则不被记录。
标签:
CTTAAG
bsubt
whole
168
上传时间:
2014-01-26
上传用户:小儒尼尼奥