RMSD: Root Mean Square Deviation 是一种在分子模拟及预测中很常见的评价标准，通过Jacobi变换来的到一个大分子和目标分子的相似程度。常用来评价一个三维结构的预测结果是否足够准确.作者主页http://dillgroup.ucsf.edu/~bosco/ 压缩包里的html里还包括有Python代码
